Samodzielna Pracownia Spektrometrii
Jądrowego Rezonansu Magnetycznego (RM)

Zespół:

Kierownik: prof. dr hab. Lech Kozerski
tel.: 022 851 43 78
022 851 43 72 wew. 316 lub 318
e-mail: 

Dr Elżbieta Bednarek
Koordynator Systemu Jakości w RM, Zastępca Kierownika ds. administracyjnych

Dr Wojciech Bocian
Zastępca Kierownika ds. naukowych

Mgr inż. Jerzy Sitkowski

Działalność RM

Działalność kontrolna RM

Podstawowym zadaniem statutowym Pracowni jest uczestnictwo w procesie rejestracji i kontroli preparatów leczniczych firm krajowych i zagranicznych na rynku polskim w zakresie badań strukturalnych.

Działalność w zakresie Systemu Jakości RM

  • Wdrażanie Systemu Jakości zgodnie z normą PN-EN ISO/IEC 17025
  • Opracowywanie procedur związanych z akredytacją laboratorium

Działalność dydaktyczna RM

Prowadzono wykłady na:
  • Studium Doktoranckim Uniwersytetu im. M. Kopernika w Toruniu
  • Studium Doktoranckim Uniwersytetu im. A. Mickiewicza w Poznaniu
  • Studium Doktoranckim Uniwersytetu Warszawskiego
  • Studium Doktoranckim Politechniki Warszawskiej
  • Studium Doktoranckim Instytutu Chemii Organicznej PAN

Działalność naukowa RM

Badania oddziaływań wewnątrz- i międzycząsteczkowych w NMR do rozwiązywania ogólnych problemów chemii farmaceutycznej i medycznej, jakimi są:
  • Badanie struktury leków
  • Badanie oddziaływania leków z biocząsteczkami (oligomery DNA)
  • Badanie mechanizmów działania leków w kompleksach z biokonjugatami
  • Modelowanie molekularne kompleksów leków z biocząsteczkami, obliczenia metodami MD parametrów termodynamicznych kompleksów bioorganicznych

Projekty badawcze RM

Od 2000r. w RM realizowano projekty badawcze:
  • Grant KBN 4 P05F 014 19
    Opracowanie struktury projektowanych leków aktywnych przeciw rakom opornym wielolekowo. 1999 - 2001 - Główny wykonawca: Lech Kozerski
  • Grant KBN 4 PO5F 037 15
    Badanie kompleksów platyny z wybranymi ligandami o znaczeniu biologicznym.
    Poszukiwanie leków o zwiększonej aktywności przeciwrakowej. 2000 - 2003.
    Główny konsultant: Lech Kozerski

Realizacja tematów Planu Naukowego NIL - 2007 r.

  • Badanie struktury insuliny ludzkiej cząsteczek modyfikowanej B31Lys-B32Arg w rozpuszczalniku woda/acetonitryl
  • Badanie kompleksów metal - ligand organiczny metodą NMR w rozpuszczalnikach organicznych i w wodzie.

RM współpracuje z:

  • Ośrodkami naukowymi w kraju:
    • Instytutem Chemii Organicznej PAN wyposażonym w aparaty: Bruker DRX 500 MHz AVANCE, 400 MHz Varian Mercury i 200 MHz Varian GEMINI 2000
    • Uniwersytetem Warszawskim
    • Politechniką Warszawską
    • Uniwersytetem im. M. Kopernika w Toruniu
    • Instytutem Chemii Przemysłowej w Warszawie
    • Instytutem Farmaceutycznym w Warszawie
    • Instytutem im. A. Mickiewicza w Poznaniu

  • Ośrodkami naukowymi za granicą:
    • Departament of Life Sciences and Chemistry, Roskilde University, Denmark Prof. Dr. P. E. Hansen (dostęp do aparatu Varian INOVA NMR, 800 MHz)
    • Department of Molecular Biology and Biotechnology, University of Sheffield Prof. Dr. M. P. Williamson (uzyskanie ważnych obiektów badań)
    • M. D. Anderson Cancer Center, University of Texas, Houston Prof. W. Priebe (uzyskanie ważnych obiektów badań)

RM oferuje usługi w zakresie:

Wykonywanie widm NMR zlecane przez instytucje głównie ze środowiska medycznego i farmaceutycznego.

Wyposażenie RM:

  • spektrometr NMR Varian - VNMRS-500;
  • sonda firmy Nalorac w detekcji odwrotnej, szerokopasmowa ( S/N, 900:1, 1-H );
  • sonda TRIPL-500 TR-PFG
  • jednostka stabilizacji temperatury w sondzie w zakresie temp. -80 oC ÷ +150oC
  • stabilizacja temperatury w pomieszczeniu NMR ÷ 0.3 oC zapewnia długotrwałe akwizycje widm cząsteczek biologicznych w wodzie bez artefaktów
  • komputer Silicon Graphics Origin z 10 procesorami, na którym prowadzone jest w Pracowni modelowanie molekularne

RM - wybrane publikacje od 2000 roku:

  1. L. Kozerski, A.P. Mazurek, R. Kawęcki, W. Bocian, P. Krajewski, E. Bednarek, J. Sitkowski , M.P. Williamson, A.J.G. Moir and P.E. Hansen
    A nicked duplex decamer DNA with a PEG6 tether.
    Nucleic Acids Research, 2001, 29 : 1132-1143
  2. L. Kozerski, B. Kwiecień , P. Krajewski, R. Kawęcki, E. Bednarek, W. Bocian, J. Sitkowski, W. Koźmiński and P. E. Hansen
    The tautomeric equilibrium and stereochemistry of β-sulfonylenamines.
    New J. Chem. 2002, 26 : 1060-1069
  3. E. Bednarek, W. Bocian, J. Poznański, J. Sitkowski, N. Sadlej-Sosnowska and L. Kozerski
    Complexation of steroid hormones: prednisolone, ethinyloestradiol and estriol with -cyclodextrin. An aqueous 1H NMR study.
    J. Chem. Soc., Perkin Trans, 2002 (2) : 999-1004
  4. W. Koźmiński, E. Bednarek, W. Bocian, J. Sitkowski, and L. Kozerski
    The new HMQC based technique for the quantitative determination of heteronuclear coupling constants. Application for the measurement of 3J(H3'i, Pi+1) in DNA oligomers.
    J. Magn. Reson., 2003, 160 : 120-125
  5. K. Samochocka, I. Fokt, R. Anulewicz-Ostrowska, T. Przewłoka, A.P. Mazurek, L. Fuks, W. Lewandowski, L. Kozerski, W. Bocian, E. Bednarek, J. Sitkowski and W. Priebe
    Platinum (II) and Palladium (II) complexes with methyl 3,4-diamino-2,3,4,6-tetradeoxy--L-lyxo- hexopyranoside.
    J. Chem. Soc. Dalton Trans., 2003, 11: 2177-2183
  6. E. Szłyk, L. Pazderski, I. Łakomska, A. Wojtczak, L. Kozerski, J. Sitkowski, B. Kamieński, H. Günther
    1H{15N} heteronuclear correlation and 15N cross-polarized magic angle spinning NMR studies of the coordination modes I Zn(II) chloride complexes with purine and methylpurines.
    Polyhedron, 2003, 22 : 391-396
  7. L. Kozerski, B. Kamieński, R. Kawęcki, Z. Urbańczyk-Lipkowska, W. Bocian, E. Bednarek, J, Sitkowski , K. Zakrzewska, K. Nielsen, P. E. Hansen
    Solution and solid state 13C NMR and X-ray of genistein complexes with amines. Potential biological function of the C-7, C-5 and C-4'-OH groups.
    Org. Biomol. Chem., 2003 (1) : 3578 - 3585
  8. W. Bocian, R. Kawęcki, E. Bednarek, J. Sitkowski, A. Pietrzyk, M.P. Williamson, P.E. Hansen and L. Kozerski
    Multiple binding modes of camptothecin family to DNA oligomers.
    Chem. Eur. J., 2004 (10) : 5776-5787
  9. E. Bednarek, W. Bocian, J. Sitkowski, A. Ulkowska, Ł. Kaczmarek, K. Badowska-Rosłonek, A. Bukowska and L. Kozerski 1H and 13C NMR data for indolo[2,3-b]quinolines - aminoglycoside hybrids, a novel potent anticancer drug family.,
    Magn. Reson. Chem., 2006, 44 : 459 - 462
  10. W. Bocian, R. Kawęcki, E. Bednarek, J. Sitkowski, A. Ulkowska and Lech Kozerski
    Interaction of Flavonoid Topoisomerases I and II Inhibitors with DNA Oligomers
    New J. Chem., 2006, 30 : 467 - 472